争议多年的重庆小南海水电站项目已经明确被环保部否决。环保部在《关于金沙江乌东德水电站环境影响报告书的批复》中指出，过去十年长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区，因为金沙江下游一期工程等进行过两次调整，已经使自然保护区功能受到较大影响，未来该流域的开发必须严格按照主体功能区定位，严守生态红线，切实严格保护长江上游珍惜、特有鱼类国家级自然保护区。《批复》提出，“不得在向家坝水电站坝址至三峡水利枢纽库尾长江干流河段和支流岷江、赤水河河段等自然保护区范围内，再规划和建设小南海水电站、朱杨溪水电站、石硼水电站及其它任何拦河坝等涉水工程。”专家认为，解决重庆电力供应，有一系列替代方案值得考虑。其中一个非常可行的方式是，重庆市和三峡集团就金沙江下游的四座大坝建立合作共享关系。重庆可把原本计划投资在小南海水电站的投资投在三峡集团四座大坝中，从而获得相应比例的所有权和利益（电能）。我们认为，过去那种只重水电、无视生态环境的部门利益决策思维，早就应该被摒弃了。无处不在的水电开发，并不像水电开发者所说的那样代表老百姓的利益，也不可能给地方经济带来可持续的福利。否决小南海水电站项目符合社会整体利益。